Озеро Айгр расположено в Армавирской области, в северной части Араратской равнины, на высоте около 860 м над уровнем моря. Озеро образовалось благодаря подземным пресноводным источникам, вытекающим из южных предгорий Арагаца на Араратскую равнину. Северный берег возвышенный и скалистый, остальные берега — низменные.
Площадь поверхности озера составляет около 0,03 км², максимальная глубина — 9,4 м, площадь водосборного бассейна — около 5 км², а объём воды — около 310 000 м³. В небольшом бассейне Айгр–Мецамор зарегистрировано около 187 видов высших цветковых растений из 44 семейств и 104 родов. Здесь бок о бок встречаются водные, болотные, галофитные, пустынные и полупустынные растительные сообщества.
Проект насосной (водозаборной) станции озера Айгр принадлежит известному архитектору Александру Таманяну.
