Le lac Aygr est situé dans la province d'Armavir, dans la partie nord de la plaine de l'Ararat, à une altitude d'environ 860 m au-dessus du niveau de la mer. Ce lac s'est formé grâce à des sources souterraines d'eau douce jaillissant des contreforts sud de l'Aragats et se déversant dans la plaine de l'Ararat. La rive nord est élevée et rocheuse, tandis que les autres rives sont basses.
La superficie du lac est d’environ 0,03 km², sa profondeur maximale est de 9,4 m, son bassin versant couvre environ 5 km² et son volume d’eau est d’environ 310 000 m³. Dans le petit bassin d’Aygr-Metsamor, environ 187 espèces de plantes à fleurs supérieures, appartenant à 44 familles et 104 genres, ont été répertoriées. Des communautés végétales aquatiques, marécageuses, halophytes, désertiques et semi-désertiques coexistent ici.
La conception de la station de pompage (prise d’eau) du lac Aygr est l’œuvre du célèbre architecte Alexandre Tamanian.